در سال ١٩٧٦ دوباره به تشکیلات مخفی حزب در محدوده سازمان رزگاری وابسته به شاخه یک (١) پیوست. در سال ١٩٨٠ به صفوف پیشمرگه‌ها بازگشت و در سازمان شهید خدر محمود وظایف پیشمرگه‌گی را انجام داد و سپس در سازمان صلاح‌الدین ایوبی به عنوان جانشین مسئول نظامی سازمان منصوب شد.
در سال ١٩٨٨، همزمان با یورش بدنام انفال و بمباران شیمیایی منطقه بادینان، به همراه تعداد زیادی از پیشمرگه‌ها و اهالی منطقه به کردستان ترکیه (باکور) رفت و سپس به اردوگاه پناهندگان موش منتقل شد. در سال ١٩٩٢ به کردستان عراق بازگشت و به عنوان فرمانده یک گروهان پیشمرگه در منطقه برواری بالا در استان دهوک تعیین شد. سپس مسئولیت گردان ٣ در کسنزان استان اربیل به او سپرده شد. در سال ١٩٩٧ به عنوان فرمانده تیپ ١٨ در سپاه ١٤ منصوب شد. در سال ١٩٩٨ به عنوان فرمانده نظامی لشکر زِیرِوانی در برواری بالا تعیین شد. در سال ٢٠٠٠ به فرماندهی نیروی ٧ در سپاه ١٨ و در سال ٢٠٠٢ به فرماندهی نیروی ٦ در سپاه ١٤ منصوب گردید.
در روز ١٤ اوت ١٩٩٨، هنگام خنثی‌سازی یک مین در زمین فوتبال روستای بیتکار در استان دهوک، مین منفجر شد و در نتیجه آن چشم چپش بینایی خود را از دست داد و گوش‌هایش شنوایی خود را از دست دادند. او در طول عمر پیشمرگه‌گی خود در حدود ٢٥ نبرد شرکت داشته و هفت بار نیز مجروح شده است.
در ماه سپتامبر سال ١٩٨٦، دو برادر، دو برادرزاده و یک پسر اسماعیل بیتکاری بر اثر بمباران جنگنده‌های رژیم عراق شهید شدند. برادر دیگرش به نام عزت نیز در ماه دسامبر همان سال به شهادت رسید. پدرش، صادق بیتکاری، که پیشمرگه انقلاب ایلول بود، در سال ١٩٩٣ در اردوگاه پناهندگان موش مسموم شد.
اسماعیل بیتکاری به دلیل معلولیت با درجه سرتیپی (لیوا) بازنشسته شد و اکنون در دهوک زندگی می‌کند. در سال ٢٠١٠ در کنگره سیزدهم حزب دموکرات کردستان توسط رئیس مسعود بارزانی مدال بارزانی به او اعطا شد.
منبع: